学校南大门是2012年的12月建成并投入使用的。大门整体设计从中间往西侧看,正立面像长城的城楼,侧立面像立着的三本书。正立面的两块浮雕分别以中岳嵩山和黄河为主元素,正好暗和了中国、中原、中医的设计脉络。校标的造型是一把钥匙的形状,寓意着学生进入河南中医学院,就像是拿到了打开中医药文化知识宝藏的一把钥匙。在继承传统中医药文化内涵的基础上,又充分融合了深厚的中原文化特色。山者为阳,沟壑为阴,白天为阳,夜晚为阴,中医文化讲求阴阳平衡,天地合一,在两块浮雕设计时,体现了阴阳和谐,协调统一的理念。西侧浮雕取的是中岳嵩山之景,图画中有嵩岳寺塔,嵩阳书院等名胜,这些是中原元素;因日者为阳,夜间为阴,为表达这些就用月亮表达夜间,整幅画面取名为:“嵩山晓月”。黄河绵延几千里,在河南最具有影响的数河洛交汇的地方,每当黄河汹涌澎湃的时候,受黄河水位上涨的影响,洛河就表现得平静如镜,所以东侧浮雕取材于河洛交汇的风景,河出图洛出书,河洛文化是中国文化的重要源泉之一,是中华文明肇始,因沟壑为阴,白天为阳,所以在画面右上方设计了一轮喷薄欲出的旭日。整幅画面取名为“河洛旭日”,也体现了阴阳的和谐统一。两块浮雕加在一起,既体现了中国中原的元素,又体现了中医药文化的阴阳平衡思想,可以说“山河与中医药文化同在,日月与中医药文化同辉”。